据用户在苹果技术支持社区的反应了解到，他们在将iPhone系统升级到iOS 9.1后发现了指纹解锁不灵问题。Touch ID功能反应变得缓慢，要么识别失败、要么直接无法识别。对此，苹果还未做出回应。无论开发团队在新产品推出之前进行过多少次测试，在发布之后，在上百万名用户总还是会出现一些问题。但对于苹果来说，它必须要以去年iOS 8升级出现系统不稳为警戒。
用户升级后的指纹识别问题情况不一。其中一名反应，当手机重启并进入低电量模式之后，Touch ID没法用了。另外一名64GB版iPhone 6s的用户称，手机的Touch ID在升级之后变得反应迟缓，或者有时候在尝试多次后直接就没法用了。
虽然有些用户在尝试了设备重启后解决这个问题，但也只是暂时性的。看来永久的解决方案只能等苹果官方提供了。